kurzer DNA- beziehungsweise RNA-Einzelstrang (Oligonucleotid), der zu einem Bereich auf einem einzelsträngigen DNA-Molekül komplementär ist und mit diesem einen Doppelstrang ausbildet. Das freie Hydroxyende dient der DNA-Polymerase als Startposition zur Synthese des neuen, komplementären Stranges (Primer-Extension). Spezifische Primer können durch Gensynthese erzeugt werden. Im Organismus sind Primer (meist RNAprimer) an der Replikation von Genomen beteiligt (Okazaki-Fragmente). Primer benötigt man z. B. bei der Polymerase-Kettenreaktion.